一、内设职能部门：
办公室、组织部、宣传部、党风政风监督室、信访室、案件监督管理室、案件审理室、纪检监察干部监督室、第一纪检监察室、第二纪检监察室、第三纪检监察室、第四纪检监察室。
二、直属事业单位：昌吉市纪委监委审查调查中心
三、昌吉市党委巡察办公室
四、派驻纪检监察组：第一纪检监察组、第二纪检监察组、第三纪检监察组、第四纪检监察组、第五纪检监察组、第六纪检监察组
五、派出市直属机关纪检监察工委
